Genma Taisen spielt in einer postapokalyptischen Welt. Die Menschheit wurde von einem dämonischen Stamm übernommen, bekannt als Genma. Die Menschen sind für sie nicht mehr, als Sklaven. In der Genma Armee befinden sich Mutanten, Zyklopen, Vampire, Werwölfe, hoch intelligente Menschenaffen und andere mystische Wesen. Der Genmaführer, König Maoh, herrscht mit eiserner Faust. Da er einen Nachfolger sucht, befiehlt Maoh seinen Gefolgsleuten, Hito-Frauen zu kidnappen, welche latente Mächte besitzen. Er ist davon überzeugt, dass ein Kind mit einer Hito-Frau erstaunliche Mächte besitzen würde.