자이아 엔터프라이즈 재팬이 사라지고, 아마츠 가이는 비서형 휴머기어 린과 함께 새로운 회사를 만들어 이노베이션을 일으키려 하고 있었다. 하지만, 가이의 몸에 갑자기 이변이 벌어지더니, 그의 몸에서 단 쿠로토가 분리되었다. 아크에 의해 인터넷을 헤매이던 최악의 버그스터 바이러스가 부활해 가이에게 감염된 것이다! 가이는 가면라이더 사우저로 변신해 바이러스를 제거하려 하지만, 그 몸은 어째서인지 검게 물들어 있었다.