Boku wordt samen met zijn vriendin Kunagisa Tomo, een computergenie met het savantsyndroom, uitgenodigd op het privé-eiland van de verbannen zaken erfgename Iria Akagami, die daar genieën uit Japan ontvangt voor haar vermaak. Na een aardbeving wordt de kunstenaar Ibuki Kanami onthoofd aangetroffen in haar atelier en Boku gaat met Kunagisa op zoek naar de moordenaar, die een van de 11 overgebleven mensen moet zijn, aangezien het eiland is afgesneden van het vasteland en Akagami Iria liever geen contact opneemt met de politie. De jacht is begonnen!