Shido Itsuka era apenas um rapaz comum do ensino secundário com uma vida normal. Mas, no último dia das férias da primavera antes do início das aulas, um Terramoto Espacial devastou a cidade e uma rapariga de armadura apareceu à sua frente. A irmã adotiva de Shido, Kotori, diz-lhe que a rapariga é uma "Criatura Designada como Desastre Especial: Espírito", que causou os Terramotos Espaciais e revelou que ela era a comandante da organização que lidava com Espíritos, Ratatoskr, e ordenou-lhe que saísse em um encontro com o Espírito para a pacificar. Kotori diz-lhe: "Não te peço para derrotar o Espírito. Apenas deixa-a apaixonar-se por ti e salva o mundo."