หลังจากปกป้อง Last Order ด้วยพลังมหาศาลของเขา Accelerator พบว่าตัวเองถูกลากเข้าสู่ความขัดแย้งครั้งใหม่ในรูปแบบขององค์กรที่น่ากลัวที่เรียกว่า Disciplinary Action ซึ่งวางแผนที่จะใช้ Last Order สำหรับภารกิจที่อันตราย ตอนนี้พวกเขาได้กำหนดแผนของพวกเขาให้เคลื่อนไหวแล้วและกำลังตามหาเด็กสาวคนนี้มันขึ้นอยู่กับเอสเปอร์ที่ทรงพลังที่สุดในโลกและเอสเธอร์โรเซนธาลเพื่อนใหม่ที่เพิ่งค้นพบเพื่อปกป้อง Last Order และปกป้อง Academy City ในกระบวนการ