Chương trình diễn ra mười năm sau phần cuối của Armada, mở ra một thời đại hòa bình trên Cybertron và Trái đất được định sẵn là không tồn tại lâu. Energon buộc các Autobot phải chống lại một loạt kẻ phản diện: Megatron tái sinh, Unicron hầu như không còn hoạt động, Alpha Q bí ẩn và tay sai Terrorcon của hắn.