Головного героя звуть Каміджо Тоума. Живе він в учнівському містечку - «Академія Сіті». Спокійно собі живе, незважаючи на своє хронічне невезіння. Не вірить ні в науку, ні в магію. Але в один прекрасний момент на своєму балконі він знаходить дівчину в дивакуватому чернечому одязі та з не менш дивним ім'ям - Індекс. Виявляється, що в її голові укладено 103 тисячі заборонених апокрифів, тобто магічних книг. Це знайомство занурює Каміджо у вир абсолютно шалених пригод. За Індексом полюють маги, а наш Тоума зобов'язаний її захистити...